Strumento di lavoro insostituibile del geologo, la colonna stratigrafica rappresenta in maniera schematica la stratificazione, dalla superficie in profondità, delle diverse rocce che si possono trovare in una certa area. In quella al centro della sala, dedicata ai Monti Prenestini, ad ogni strato corrispondono campioni significativi e una rappresentazione di come si presentano negli affioramenti sul terreno. Si riassumono così molte informazioni sulla geologia di un territorio e sugli ambienti in cui si sono formate le sue rocce.