Due sale ospitano la preziosa collezione di uccelli di Ettore Arrigoni degli Oddi, in parte conservata negli armadi originali resi visibili al pubblico. A differenza delle nuove sale tematiche, questi spazi offrono uno sguardo autentico, attualizzato, sulla concezione ottocentesca di “museo”, con vetrine piene di animali, che spesso mostrano anche numerosi esemplari di un’unica specie, corredati da cartellini identificativi. Donata al museo nel 1937, la collezione Arrigoni degli Oddi rappresenta la più importante raccolta ornitologica in Italia, con oltre 11.000 reperti.